В журнале Science вышла работа исследователей из Института Брода Массачусетского технологического института и Гарварда, в которой описан новый метод массового параллельного рибосомного профилирования, MPRP. С его помощью ученые обнаружили более 4 тысяч ранее неаннотированных ОРС, открытых рамок считывания, в 679 вирусных геномах, связанных с человеком.
Некоторые вирусные гены трудно исследовать стандартными методами, так как они кодируют белки в коротких или нестандартных участках. Эти скрытые области могут играть важную роль в размножении вируса и уклонении от иммунной системы. Новый метод позволяет изучать такие участки с помощью синтетических копий вирусных последовательностей, экспрессированных в человеческих клетках.
MPRP выявил множество ORF, которые ранее оставались незамеченными, включая области, начинающиеся не с привычного стартового сигнала, и сегменты, подавляющие выработку других белков. Некоторые из этих участков оказались вовлечены в иммунное распознавание — пептиды из новых ORF были найдены на поверхности клеток, что делает их потенциальными мишенями для вакцин.
Метод позволил точно смоделировать, как вирусы типа гриппа А и гепатита С производят белки в клетках. Он также выявил скрытые белки у опасного вируса птичьего гриппа. Ученые предполагают, что такая технология поможет быстрее изучать недавно выявленные вирусы и находить новые подходы к лечению и профилактике.
Недавнее обнаружение вирусных белков открывают новые горизонты для борьбы с инфекциями и иммунными реакциями. Интересно, что вирусы могут быть не только врагами, но и союзниками в медицине — они начинают использоваться для лечения рака. Ранее Наука Mail рассказала, как специально модифицированные вирусы помогают уничтожать злокачественные клетки, активируя иммунную систему и давая надежду на новые методы терапии.