Команда Института водной биологии Академии наук Китая с помощью секвенирования de novo и комплексного анализа всего генома 464 видов рыб построила наиболее полную карту генома рыб, которая обеспечивает высокое разрешение для анализа эволюции обширной группы водных позвоночных животных.
Рыбы — самая многочисленная и морфологически обильная группа позвоночных на Земле. На их долю приходится около половины от общего числа существующих видов позвоночных. Они широко распространены в различных водах, от глубоководных морей до высокогорных озер, и обладают высокой экологической приспособляемостью и эволюционным разнообразием.
Однако геномные данные между различными таксонами неодинаковы, и не хватает систематических сравнительных данных, охватывающих всех эукариот. Этот пробел мешает ученым раскрыть эволюционные законы рыб на геномном уровне и исследовать механизм формирования ключевых признаков.
Проект под названием Fish 10000 Genomes Project Китай запустил еще в 2019 году. Его цель — картирование генома 10 тыс. видов рыб, обитающих по всему миру, и создание крупномасштабной и высококачественной базы данных генома рыб.
За шесть лет ученым удалось создать общегеномную сравнительную матрицу, охватывающую все 44 отряда настоящих костистых рыб. С точки зрения аналитической точности этот ресурс сопоставим с крупномасштабными проектами по изучению генома млекопитающих и птиц.
В ходе исследования были проанализированы структурные характеристики генома эукариотических рыб, динамика транспозонов — участков ДНК, способных к передвижению и размножению в пределах генома, сохраненные и инновационные элементы, филогенетические взаимосвязи и темпы эволюции, а также выявлена роль репликации генома. Этот результат заложил информационную основу для понимания законов эволюции геномов позвоночных, происхождения признаков и механизма экологической адаптации.
Завершение проекта поможет обеспечить молекулярную основу для разведения рыбы и предоставит справочные материалы по аквакультуре и сохранению морской экологии.
Ранее Наука Mail рассказывала о том, что экологи предложили использовать затонувшие корабли для восстановления популяции рыб.
