Специалисты Федерального исследовательского центра химической физики им. Н.Н. Семенова РАН разработали уникальный биоинформатический алгоритм, который улучшит диагностику и поиск методов лечения нейродегенеративных болезней.
Технология анализирует ошибки в «сборке» белков в нервных клетках при болезни Альцгеймера. Один и тот же ген может быть «прочитан» по-разному — этот процесс называется альтернативным сплайсингом. При заболевании эта система дает сбой, и клетки производят дефектные белки, что приводит к проблемам. Алгоритм отслеживает именно эти ошибки.
Разработанный нами алгоритм поспособствует развитию прецизионной диагностики, улучшит обоснование терапевтических мишеней и подскажет новые подходы для лечения нейродегенеративных заболеваний. В дальнейшем мы планируем детально рассмотреть находки на всех клеточных уровнях, чтобы понять первопричину наблюдаемых при болезни изменений. Представленная нами база данных послужит основой для будущих биомолекулярных и биохимических исследований, направленных на всестороннее понимание роли альтернативного сплайсинга при болезни Альцгеймера.
Алгоритм TMTCrunch применили к более чем 420 образцам мозга, что позволило выявить 870 специфичных для болезни изменений, которые затронули:
- белки, ответственные за ионный транспорт;
внутриклеточную сигнализацию;
цитоскелет, включая ключевой белок MAPT.
Исследователи впервые предсказали, что снижение определенной изоформы белка ASPH нарушает сетевые взаимодействия в нейронах. Инновация углубляет понимание причин нейродегенерации и открывает новые направления для поиска терапии. Результаты работы опубликованы в Journal of Proteome Research.
Ранее Наука Mail писала о том, что атрофия мышц ухудшает когнитивные способности людей с болезнью почек.
