Исследователи Института цитологии и генетики Сибирского отделения РАН создали уникальный информационный ресурс Termo_Reg_Human 1.0 — первую комплексную базу знаний, систематизирующую все известные молекулярные компоненты системы терморегуляции человека.
База находится в открытом доступе и содержит сведения о 469 генах, 473 белках и 265 микроРНК, а также о связях между ними и их эволюционных характеристиках.
Мы расставили приоритеты внутри этой сети и показали, какие гены, белки и микроРНК играют наиболее важную роль. Это особенно важно для прикладных задач, например, при поиске генов-кандидатов, связанных со способностью адаптации к холоду или жаре
Для создания базы ученые использовали разработанную в ИЦиГ платформу ANDSystem, которая автоматически извлекает факты о взаимодействиях генов и белков из научных публикаций, патентов и баз данных. Ключевым результатом стал не просто сбор информации, а выявление ключевых «узлов» терморегуляции — четырех генов, пяти белков и двух микроРНК, имеющих наибольшее число связей в сети.
Как пояснил ведущий научный сотрудник Николай Юдин, найденные гены-«хабы» контролируют сразу множество других генов. Именно с них логично начинать любое воздействие. База знаний пригодится в медицине — для оценки способности человека адаптироваться к экстремальному климату, а также в животноводстве — для селекции пород, устойчивых к температурным стрессам.
Ранее Наука Mail писала о российском роботе для лабораторных экспериментов.
