Исследователи ИТМО нашли новый механизм работы препарата иринотекана — это известное противоопухолевое средство, которое действует на белок, регулирующий структуру ДНК и связанный с развитием рака. Оказалось, что иринотекан может быть эффективен и против другого белка — А2В1, который связан с развитием рака прямой кишки, легких и других видов онкологии.
Белок hnRNPA2B1 или A2B1 был открыт в 2011 году. Исследования показывают, что количество этого белка повышено в раковых клетках — он отвечает за их стабильность. Последние годы специалисты активно изучают A2B1, но в Международной базе данных биологически активных малых молекул и лекарственных препаратов ChEMBL не было записей о соединениях, которые могли бы связываться с белком А2В1.
С помощью методов компьютерного моделирования выяснили, что связываться с A2B1 и останавливать рост раковых клеток способен иринотекан. Ученые использовали данные о взаимодействии молекулы камптотецина с белком А1 — «родственником» A2B1. А1 считается биологически активным соединением, активным против рака молочной железы, яичников, толстой кишки, легких и желудка.
Чтобы проверить, как лекарство связывается с белками, ученые использовали методы молекулярного докинга и молекулярной динамики. Первый показал лучшее положение 3D-структур белка и молекулы, в котором они встраиваются друг в друга и образуют устойчивый комплекс. Второй метод помог проверить стабильность этого соединения во времени.
Исследователи увидели, что молекулы препарата прочно связываются с A2B1. Результаты подтвердили и экспериментально — для этого использовали методику фиксации белков на сенсоре, чтобы молекулы сохраняли свои свойства и структуру, оставаясь пригодными для исследований.
Мы сравнили, как две молекулы с противораковыми свойствами связываются с родственными белками, участвующими в развитии рака. За счет этого мы показали, что у противоракового препарата иринотекан есть дополнительная мишень — наш белок А2В1. Теоретически, дезактивируя этот белок с помощью известного препарата, можно избирательно тормозить прогрессирование различных видов рака и использовать более щадящую терапию для пациента, например, с меньшими дозами облучения
В своем исследовании ученые опирались на международные базы данных, например, полученную от Управления по контролю качества пищевых продуктов и лекарственных средств США (FDA). Теперь ученые ИТМО планируют изучить, как другие препараты из этой базы взаимодействуют с А2В1. Они ожидают получить список наиболее перспективных лекарств, которые затем проверят экспериментально.
Ранее Наука Mail рассказывала, что в России получены новые вещества для контроля раковых клеток.
