Ученые из Школы общественного здравоохранения Мейлмана при Колумбийском университете совершили прорыв в понимании того, как взаимодействие между геномами человека и вируса формирует риск развития заболеваний. Оказалось, что мутации вируса Эпштейна-Барр в сочетании со специфическим иммунным геном сильно повышают вероятность рака носоглотки. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature.
Вирусом Эпштейна-Барр инфицировано больше 95% взрослого населения во всем мире, однако лишь у крошечной доли носителей развиваются связанные с ним онкологические заболевания. Долгое время этот феномен оставался медицинской загадкой. Чтобы понять причину, специалистам потребовалось выяснить, как именно генетические факторы хозяина и вируса совместно влияют на вероятность перерождения здоровых клеток в злокачественные.
Вместо того чтобы анализировать генетические вариации человека или вируса по отдельности, исследовательская команда применила инновационный комплексный подход. Исследователи объединили данные полногеномного анализа ассоциаций человека с результатами полного секвенирования генома вируса. Это позволило провести масштабный и систематический поиск скрытых генетических взаимодействий одновременно в обеих сложных биологических системах.
Используя этот метод, команда выявила ключевое взаимодействие между человеческой аллелью HLA-A*11:01 и вирусным вариантом (SNP 85841G) в гене EBNA3B. Полученные результаты убедительно доказывают, что риск развития рака формируется не исключительно генетикой хозяина или опасным вирусным штаммом, а их комбинированным эффектом. Люди с восприимчивым генетическим фоном при заражении таким штаммом подвергаются колоссальному риску.
Большинство классических генетических исследований рассматривает геном хозяина или патогена строго по отдельности. Совместный анализ обеих структур с использованием передовых методов статистической генетики и причинно-следственных связей позволил выявить те угрозы, которые раньше оставались абсолютно невидимыми. Учет структуры популяций в обоих геномах позволил добиться высокой точности статистических выводов.
Ранее Наука Mail рассказывала, что биологи смогли рассмотреть процесс размножения вируса в клетках в 3D.
