Бактериофаги, убивающие бактерии, незаменимы в биотехнологиях и медицине, однако в лабораториях они часто становятся причиной проблем. Вирусы семейства T1 годами выживают на оборудовании, проходят через фильтры и способны за одну ночь уничтожить все бактериальные культуры, сорвав производство или эксперимент. Ученые долго не могли понять, какие гены обеспечивают такую живучесть.
Группа под руководством Артема Исаева из Сколтеха (входит в группу ВЭБ.РФ) выделила из воды реки в Калининграде новый фаг, названный KanT1 в честь Иммануила Канта. В пресс-службе Сколтеха пояснили, что он заражает многие штаммы кишечной палочки, используемые в лабораториях, и устойчив к дезинфекции. Результаты работы опубликованы в International Journal of Molecular Sciences.
Ключевым открытием стало применение структурного прогнозирования белков через систему AlphaFold3. Это позволило описать функции тех белков, которые ранее считались гипотетическими и составляют почти половину генома. Ученые обнаружили белок со структурой SH3-домена. Раньше такие структуры находили только у вирусов, которые заражают бактерии с толстой оболочкой. У вирусов кишечной палочки (с тонкой оболочкой) такой белок встретился впервые.
Обнаружение SH3-домена у фага, поражающего грамотрицательную бактерию, стало для нас неожиданностью. Мы предположили, что SH3-белок помогает фагу эффективнее разрушать клетку, что может объяснять его агрессивность
Исследователи также выяснили, что штамм кишечной палочки HS полностью невосприимчив к этим вирусам. Это означает, что в лабораториях можно использовать этот штамм вместо чувствительных культур, чтобы избежать контаминации.
Ранее специалисты Сколтеха вместе с сотрудниками Курчатовского института открыли механизм действия антибиотика боттромицина А2.
