Ученые создали большой биобанк моделей опухолей — органоидов — чтобы лучше изучать рак и искать способы лечения. В него вошли 256 моделей, полученных из образцов пяти видов рака: колоректального, пищеводного, панкреатического, желудочного и яичникового. Образцы предоставили пациенты, давшие согласие на исследование; их оперативно доставляли из больниц в Институт Велкома Сангера, где из клеток выращивали органоиды, которые оказались точнее, чем привычные плоские клеточные культуры, повторяют структуру настоящей опухоли.
Чтобы найти уязвимые места раковых клеток, исследователи применили метод CRISPR‑скрининга и по очереди отключали гены и смотрели, без каких из них клетки не могут выжить. На 162 моделях выявили тысячи генетических зависимостей, в том числе общие для разных видов рака и специфические для отдельных опухолей. Еще ученые сравнили ДНК органоидов, исходных опухолей и образцов крови, что помогло отследить изменения и убедиться, что модели верно отражают особенности реального рака.
Важный результат — 1733 связи между генетическими зависимостями и особенностями опухолей, например, изменениями в ДНК или реакцией на лечение. В отдельных случаях сравнение моделей от одного пациента до и после терапии показало, как опухоль становится устойчивой к лекарствам и какие новые слабые места у нее появляются.
Биобанк не заменяет старые модели, а дополняет их: вместе они дают ученым более полную картину и помогают быстрее переходить от лабораторных открытий к реальным методам лечения. Такой ресурс позволит точнее подбирать терапевтические подходы и разрабатывать менее токсичные и более эффективные способы борьбы с раком.
Ранее Наука Mail рассказывала о том, что ученые обманули раковые клетки и победили опухоль.