Исследователи из лаборатории Беркли представили метод автоматизированной микроскопии, потоковую службу для более быстрой передачи данных и простую веб-платформу, объединяющую эти два метода.
Автоматизированный электронный микроскоп может действовать по алгоритму, например, сфокусировать изображение, затем сделать снимок, переместить фокус и все повторить для нового участка. Объединяясь в последовательную цепочку, алгоритмы позволяют выполнять длительные эксперименты для создания большой карты из сетки изображений.
Следствием автоматизации является повышение скорости обработки больших объемов данных. Быстрые детекторы могут производить до 700 Гб информации за 15 секунд, а это создает проблемы хранения и обработки данных, а также их перемещения. Первоначально микроскоп был ограничен 15 минутами работы из-за нехватки места на жестком диске. Однако ученые разработали метод эффективной потоковой передачи данных, полностью пропуская диск.
Этот метод аналогичен потоковой передаче видео на смартфон — вместо того, чтобы сначала загружать полный файл, зритель может смотреть видео по мере его передачи. Так что теперь с помощью веб-платформы пользователь может отслеживать сбор данных в режиме реального времени, передавать данные на суперкомпьютер и обрабатывать их во время живого эксперимента. По сравнению с обычным процессом передачи файлов этот метод в 14 раз быстрее и надежнее, что в целом выводит изучение гетерогенных материалов на новый уровень.
Ученые также нашли способ автоматизировать перемещение микроскопического биоматериала в лабораториях.
