Почва — настоящий склад микробов. Многие антибиотики, которыми мы лечимся сегодня, были когда-то найдены именно в ней. Проблема в том, что вырастить большинство из них в лаборатории невозможно. А значит, большая часть «микробного мира» до сих пор оставалась вне поля зрения науки.
Команда под руководством Шона Брэди из Рокфеллеровского университета (США) преодолела эти ограничения. Раньше исследователи получали из почвы крошечные обрывки ДНК, которые трудно было собрать в единую картину. Теперь используют технологию «длинных чтений» (long-read nanopore sequencing): она позволяет сразу получать большие фрагменты ДНК, и пазл складывается гораздо легче.
В итоге исследователи собрали сотни полных бактериальных геномов, больше 99% из которых оказались новыми для науки. Из этих данных удалось выделить два вещества, которые могут стать антибиотиками. Первое, эрутацидин, разрушает мембраны бактерий и помогает справляться даже с самыми устойчивыми штаммами. Второе, тригинтамицин, воздействует на белок ClpX — очень редкую мишень для антибиотиков. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Biotechnology.
Ранее Наука Mail писала, что в Чили обнаружили бактерии, устойчивые ко всем современным антибиотикам.
