
Каждый год от желудочно-кишечных инфекций, вызванных бактериальными патогенами, умирают более полумиллиона детей младше пяти лет. Эти смерти в основном происходят в странах с ограниченным доступом к чистой воде, санитарии и гигиене.
Чтобы эффективно бороться с этой угрозой, ученым необходимо точно понимать, как именно передаются такие бактерии, как Escherichia coli (E. coli). Работа исследователей Калифорнийского университета в Беркли (США) опубликована в журнале Nature Microbiology.
До сих пор основной акцент в подобных исследованиях делался на передачу бактерий между животными и людьми. Однако команда под руководством Эми Пикеринг, доцента кафедры гражданского и экологического строительства, решила сосредоточиться на том, как каждый из трех основных путей — человек, животное и окружающая среда — способствует распространению бактерий. Для анализа ученые применили собственный метод PIC-seq (Pooled Isolated Colonies-seq), который позволяет секвенировать сразу до пяти штаммов бактерий из одного образца (вместо традиционного одного штамма на образец).

Исследование проходило в городских трущобах столицы Кении Найроби, где люди часто хранят питьевую воду в канистрах или пластиковых ведрах. Ученые собрали больше 100 образцов — человеческие и животные фекалии, воду и почву. После культивирования бактерий и анализа с помощью PIC-seq оказалось, что штаммы E. coli чаще передавались через хранящуюся воду, чем через контакт с домашними животными.
Многие из найденных штаммов несли гены устойчивости к антибиотикам. Такие гены способны быстро распространяться между разными бактериями, усиливая проблему устойчивых инфекций — одну из главных угроз глобальному здравоохранению. В домах, где использовалась хлорированная вода, уровень бактериального загрязнения был значительно ниже. Это говорит о том, что даже простые меры вроде регулярного обеззараживания питьевой воды могут существенно снизить риски.
Таким образом, исследование подчеркивает важность качественной питьевой воды не только для предотвращения инфекций, но и для сдерживания распространения устойчивых к антибиотикам бактерий. Это особенно важно в уязвимых сообществах, где дети находятся в наибольшей опасности.
Ранее Наука Mail рассказывала о том, что ученые подсчитали, сколько лунного «мусора» попадает на Землю.