В США исследователи из Массачусетского технологического института (MIT), Гарвардского университета и Института Броуда разработали новый вычислительный подход, способный предсказывать местонахождение разных видов белков в клеточной линии человека, рассказали в пресс-службе MIT.
Вручную определить местоположение всех из примерно 70 тыс. белков слишком сложно и дорого. Прежние вычислительные методы основывались на массивах данных о белках, например, Human Protein Atlas. Но даже этот набор содержит информацию только о 13 тыс. белков в 40 клеточных линиях, что составляет всего 0,25% от возможных сочетаний.
Новый метод призван ускорить исследование оставшейся неизученной части белков. В отличие от предыдущих способов, он работает в пределах отдельной клетки, что позволяет точно определять расположение полипептидов в конкретной точке.
Авторы исследования объединили языковую модель белков с системой компьютерного зрения. На выходе пользователь получает изображение клетки с выделением области, где, по мнению ИИ, находится белок. Ученым остается перепроверить данные нейросети. Однако даже такая подсказка намного упрощает работу и позволяет более целенаправленно искать биохимические вещества.
Такой подход может ускорить постановку диагноза и поиск необходимых лекарств для предотвращения заболеваний. Как известно, неправильное расположение протеинов в клетке может вызвать болезнь Альцгеймера или рак.
Специалисты добавили, что их целью также является повышение понимания процессов, зависящих от локализации белков. По словам автора исследования Йитона Тсео, подобные эксперименты теперь можно проводить на компьютере, экономя месяцы работы в лаборатории.
Ранее Наука Mail рассказала о том, как нейросети предотвращают инсульты.
